publications

Found 25 results
2020
M. N. Stewart, Parker, M. F. L. , Jivan, S. , Luu, J. M. , Huynh, T. L. , Schulte, B. , Seo, Y. , Blecha, J. E. , Villanueva-Meyer, J. E. , Flavell, R. R. , VanBrocklin, H. F. , Ohliger, M. A. , Rosenberg, O. , and Wilson, D. M. , High Enantiomeric Excess In-Loop Synthesis of d-[methyl-C]Methionine for Use as a Diagnostic Positron Emission Tomography Radiotracer in Bacterial Infection., ACS Infect Dis, vol. 6, no. 1, pp. 43-49, 2020.
D. E. Gordon, Jang, G. M. , Bouhaddou, M. , Xu, J. , Obernier, K. , White, K. M. , O’Meara, M. J. , Rezelj, V. V. , Guo, J. Z. , Swaney, D. L. , Tummino, T. A. , Huettenhain, R. , Kaake, R. M. , Richards, A. L. , Tutuncuoglu, B. , Foussard, H. , Batra, J. , Haas, K. , Modak, M. , Kim, M. , Haas, P. , Polacco, B. J. , Braberg, H. , Fabius, J. M. , Eckhardt, M. , Soucheray, M. , Bennett, M. J. , Cakir, M. , McGregor, M. J. , Li, Q. , Meyer, B. , Roesch, F. , Vallet, T. , Kain, A. Mac, Miorin, L. , Moreno, E. , Naing, Z. Zar Chi, Zhou, Y. , Peng, S. , Shi, Y. , Zhang, Z. , Shen, W. , Kirby, I. T. , Melnyk, J. E. , Chorba, J. S. , Lou, K. , Dai, S. A. , Barrio-Hernandez, I. , Memon, D. , Hernandez-Armenta, C. , Lyu, J. , Mathy, C. J. P. , Perica, T. , Pilla, K. B. , Ganesan, S. J. , Saltzberg, D. J. , Rakesh, R. , Liu, X. , Rosenthal, S. B. , Calviello, L. , Venkataramanan, S. , Liboy-Lugo, J. , Lin, Y. , Huang, X. - P. , Liu, Y. F. , Wankowicz, S. A. , Bohn, M. , Safari, M. , Ugur, F. S. , Koh, C. , Savar, N. Sadat, Tran, Q. Dinh, Shengjuler, D. , Fletcher, S. J. , O’Neal, M. C. , Cai, Y. , Chang, J. C. J. , Broadhurst, D. J. , Klippsten, S. , Sharp, P. P. , Wenzell, N. A. , Kuzuoglu, D. , Wang, H. - Y. , Trenker, R. , Young, J. M. , Cavero, D. A. , Hiatt, J. , Roth, T. L. , Rathore, U. , Subramanian, A. , Noack, J. , Hubert, M. , Stroud, R. M. , Frankel, A. D. , Rosenberg, O. S. , Verba, K. A. , Agard, D. A. , Ott, M. , Emerman, M. , Jura, N. , von Zastrow, M. , Verdin, E. , Ashworth, A. , Schwartz, O. , d’Enfert, C. , Mukherjee, S. , Jacobson, M. , Malik, H. S. , Fujimori, D. G. , Ideker, T. , Craik, C. S. , Floor, S. N. , Fraser, J. S. , Gross, J. D. , Sali, A. , Roth, B. L. , Ruggero, D. , Taunton, J. , Kortemme, T. , Beltrao, P. , Vignuzzi, M. , García-Sastre, A. , Shokat, K. M. , Shoichet, B. K. , and Krogan, N. J. , A SARS-CoV-2 protein interaction map reveals targets for drug repurposing, Nature, 2020.
M. F. L. Parker, Luu, J. M. , Schulte, B. , Huynh, T. L. , Stewart, M. N. , Sriram, R. , Yu, M. A. , Jivan, S. , Turnbaugh, P. J. , Flavell, R. R. , Rosenberg, O. S. , Ohliger, M. A. , and Wilson, D. M. , Sensing Living Bacteria in Vivo Using d-Alanine-Derived 11C Radiotracers, ACS Central Science, 2020.
I. Lui, Zhou, X. X. , Lim, S. A. , Elledge, S. K. , Solomon, P. , Rettko, N. J. , Zha, B. Shoshana, Kirkemo, L. L. , Gramespacher, J. A. , Liu, J. , Muecksch, F. , Lorenzi, J. Cesar Cetr, Schmidt, F. , Weisblum, Y. , Robbiani, D. F. , Nussenzweig, M. C. , Hatziioannou, T. , Bieniasz, P. D. , Rosenburg, O. S. , Leung, K. K. , and Wells, J. A. , Trimeric SARS-CoV-2 Spike interacts with dimeric ACE2 with limited intra-Spike avidity, bioRxiv, 2020.
2019
K. Kundert, Lucas, J. E. , Watters, K. E. , Fellmann, C. , Ng, A. H. , Heineike, B. M. , Fitzsimmons, C. M. , Oakes, B. L. , Qu, J. , Prasad, N. , Rosenberg, O. S. , Savage, D. F. , El-Samad, H. , Doudna, J. A. , and Kortemme, T. , Controlling CRISPR-Cas9 with ligand-activated and ligand-deactivated sgRNAs., Nat Commun, vol. 10, no. 1, p. 2127, 2019.
J. M. Peters, Koo, B. - M. , Patino, R. , Heussler, G. E. , Hearne, C. C. , Qu, J. , Inclan, Y. F. , Hawkins, J. S. , Lu, C. H. S. , Silvis, M. R. , M. Harden, M. , Osadnik, H. , Peters, J. E. , Engel, J. N. , Dutton, R. J. , Grossman, A. D. , Gross, C. A. , and Rosenberg, O. S. , Enabling genetic analysis of diverse bacteria with Mobile-CRISPRi, Nature Microbiology, vol. 4, no. 2, pp. 244 - 250, 2019.
J. Qu, Prasad, N. K. , Yu, M. A. , Chen, S. , Lyden, A. , Herrera, N. , Silvis, M. R. , Crawford, E. , Looney, M. R. , Peters, J. M. , and Rosenberg, O. S. , Modulating Pathogenesis with Mobile-CRISPRi., J Bacteriol, vol. 201, no. 22, 2019.
N. Poweleit, Czudnochowski, N. , Nakagawa, R. , Trinidad, D. D. , Murphy, K. C. , Sassetti, C. M. , and Rosenberg, O. S. , The structure of the endogenous ESX-3 secretion system., Elife, vol. 8, 2019.
A. Fay, Czudnochowski, N. , Rock, J. M. , Johnson, J. R. , Krogan, N. J. , Rosenberg, O. , and Glickman, M. S. , Two Accessory Proteins Govern MmpL3 Mycolic Acid Transport in Mycobacteria., mBio, vol. 10, no. 3, 2019.
2018
C. A. Mutch, Ordonez, A. A. , Qin, H. , Parker, M. , Bambarger, L. E. , Villanueva-Meyer, J. E. , Blecha, J. , Carroll, V. , Taglang, C. , Flavell, R. , Sriram, R. , VanBrocklin, H. , Rosenberg, O. , Ohliger, M. A. , Jain, S. K. , Neumann, K. D. , and Wilson, D. M. , [C]Para-Aminobenzoic Acid: A Positron Emission Tomography Tracer Targeting Bacteria-Specific Metabolism., ACS Infect Dis, 2018.
R. Sriram, Sun, J. , Villanueva-Meyer, J. , Mutch, C. , Santos, J. De Los, Peters, J. , Korenchan, D. E. , Neumann, K. , Van Criekinge, M. , Kurhanewicz, J. , Rosenberg, O. , Wilson, D. , and Ohliger, M. A. , Detection of Bacteria-Specific Metabolism Using Hyperpolarized [2-C]Pyruvate., ACS Infect Dis, vol. 4, no. 5, pp. 797-805, 2018.
2017
C. A. Elwell, Czudnochowski, N. , Von Dollen, J. , Johnson, J. R. , Nakagawa, R. , Mirrashidi, K. , Krogan, N. J. , Engel, J. N. , and Rosenberg, O. S. , Chlamydia interfere with an interaction between the mannose-6-phosphate receptor and sorting nexins to counteract host restriction, eLife, vol. 6, p. e22709, 2017.
K. D. Neumann, Villanueva-Meyer, J. E. , Mutch, C. A. , Flavell, R. R. , Blecha, J. E. , Kwak, T. , Sriram, R. , VanBrocklin, H. F. , Rosenberg, O. S. , Ohliger, M. A. , and Wilson, D. M. , Imaging Active Infection in vivo Using D-Amino Acid Derived PET Radiotracers, Scientific Reports, vol. 7, no. 1, 2017.
2015
K. M. Mirrashidi, Elwell, C. A. , Verschueren, E. , Johnson, J. R. , Frando, A. , Von Dollen, J. , Rosenberg, O. , Gulbahce, N. , Jang, G. , Johnson, T. , Jäger, S. , Gopalakrishnan, A. M. , Sherry, J. , Dunn, J. Dan, Olive, A. , Penn, B. , Shales, M. , Cox, J. S. , Starnbach, M. N. , Derre, I. , Valdivia, R. , Krogan, N. J. , and Engel, J. , Global Mapping of the Inc-Human Interactome Reveals that Retromer Restricts Chlamydia Infection., Cell Host Microbe, vol. 18, no. 1, pp. 109-21, 2015.
O. S. Rosenberg, Dovala, D. , Li, X. , Connolly, L. , Bendebury, A. , Finer-Moore, J. , Holton, J. , Cheng, Y. , Stroud, R. M. , and Cox, J. S. , Substrates Control Multimerization and Activation of the Multi-Domain ATPase Motor of Type VII Secretion., Cell, vol. 161, no. 3, pp. 501-12, 2015.
2014
H. Hadjivassiliou, Rosenberg, O. S. , and Guthrie, C. , The crystal structure of S. cerevisiae Sad1, a catalytically inactive deubiquitinase that is broadly required for pre-mRNA splicing., RNA, vol. 20, no. 5, pp. 656-69, 2014.
M. Abedalthagafi, Rosenberg, O. , and Miller, S. , First report of tenosynovitis in an immunocompetent person caused by Mycobacterium heraklionense, vol. 1, no. 2, 2014.
M. B. Lohse, Rosenberg, O. S. , Cox, J. S. , Stroud, R. M. , Finer-Moore, J. S. , and Johnson, A. D. , Structure of a new DNA-binding domain which regulates pathogenesis in a wide variety of fungi., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 111, no. 29, pp. 10404-10, 2014.
2013
T. C. Scharschmidt, Amerson, E. H. , Rosenberg, O. S. , Jacobs, R. A. , McCalmont, T. H. , and Shinkai, K. , Immune reconstitution reactions in human immunodeficiency virus-negative patients: report of a case and review of the literature., JAMA Dermatol, vol. 149, no. 1, pp. 74-8, 2013.
2011
O. S. Rosenberg, Dovey, C. , Tempesta, M. , Robbins, R. A. , Finer-Moore, J. S. , Stroud, R. M. , and Cox, J. S. , EspR, a key regulator of Mycobacterium tuberculosis virulence, adopts a unique dimeric structure among helix-turn-helix proteins., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 108, no. 33, pp. 13450-5, 2011.
L. H. Chao, Stratton, M. M. , Lee, I. - H. , Rosenberg, O. S. , Levitz, J. , Mandell, D. J. , Kortemme, T. , Groves, J. T. , Schulman, H. , and Kuriyan, J. , A mechanism for tunable autoinhibition in the structure of a human Ca2+/calmodulin- dependent kinase II holoenzyme., Cell, vol. 146, no. 5, pp. 732-45, 2011.
2006
O. S. Rosenberg, Deindl, S. , Comolli, L. R. , Hoelz, A. , Downing, K. H. , Nairn, A. C. , and Kuriyan, J. , Oligomerization states of the association domain and the holoenyzme of Ca2+/CaM kinase II., FEBS J, vol. 273, no. 4, pp. 682-94, 2006.
2005
O. S. Rosenberg, Deindl, S. , Sung, R. - J. , Nairn, A. C. , and Kuriyan, J. , Structure of the autoinhibited kinase domain of CaMKII and SAXS analysis of the holoenzyme., Cell, vol. 123, no. 5, pp. 849-60, 2005.
2003
D. J. Terlouw, Nahlen, B. L. , Courval, J. M. , Kariuki, S. K. , Rosenberg, O. S. , Oloo, A. J. , Kolczak, M. S. , Hawley, W. A. , Lal, A. A. , and Kuile, F. O. ter, Sulfadoxine-pyrimethamine in treatment of malaria in Western Kenya: increasing resistance and underdosing., Antimicrob Agents Chemother, vol. 47, no. 9, pp. 2929-32, 2003.
D. J. Terlouw, Courval, J. M. , Kolczak, M. S. , Rosenberg, O. S. , Oloo, A. J. , Kager, P. A. , Lal, A. A. , Nahlen, B. L. , and Kuile, F. O. ter, Treatment history and treatment dose are important determinants of sulfadoxine-pyrimethamine efficacy in children with uncomplicated malaria in Western Kenya., J Infect Dis, vol. 187, no. 3, pp. 467-76, 2003.

join the lab!

Graduate Students

Come and do a rotation


Post-Doctoral Researchers

Preference will be given to those with a background in structural biology or bacterial pathogenesis.

E-mail a CV and cover letter to oren.rosenberg [at sign] ucsf.edu. Please describe your background experience; what about the lab interests you and your career goals.

WE'RE HIRING!  Research Associate

We are looking for a recent college graduate with a background in cell culture technique. Experience in a BSL-3 facility is a strong positive, but not required.  Here is a link to the full description.

E-mail a CV and cover letter to oren.rosenberg [at sign] ucsf.edu.